Информация

Протокол для снятия контрольных точек ДНК?

Протокол для снятия контрольных точек ДНК?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Есть ли какой-либо метод для извлечения данных из клеток по точкам разрыва ДНК? Я нашел эту статью, в которой описывается метод обогащения одноцепочечных точек разрыва ДНК из событий мейотической рекомбинации:
Хиль П.П., Смагулова Ф., Кирпич К.М., Камерини-Отеро Р.Д., Петухова Г.В.. 2012. Чувствительное картирование горячих точек рекомбинации с использованием обнаружения оцДНК на основе секвенирования. Исследование генома 22: 957-65.

Я хотел бы знать, есть ли что-то подобное, что будет воздействовать на любой статус клеточного цикла, не только на мейоз.


В статье, которую вы цитируете, говорится, что точки разрыва представляют собой одноцепочечную ДНК, с которой связаны определенные белки.

Я здесь не эксперт, но если это причина мейтотических точек останова, есть несколько интересных возможностей для их обнаружения:

вы можете обнаружить их с помощью тайлового массива. - это микромассив, который имеет олигомер примерно через каждые 40 п.н. генома. Массив можно использовать в эксперименте CHP, который обнаруживает те же белки, что и в этой статье.

Возможно, что массив мог бы гибридизировать одноцепочечную ДНК из генома, если бы условия были подходящими. Хотя это звучит шумно.

С дешевой стороны можно было бы использовать ПЦР для копирования одноцепочечной ДНК из препарата хромосомной ДНК. Если используемые олигонуклеотиды помечены, скажем, стрептавидином, их можно выделить, повторно амплифицировать и секвенировать без больших затрат.

любой из них звучит как неплохая работа :)


Ответ - да, не только мейотические, но и любые двухцепочечные разрывы ДНК будут обнаруживаться, пока они обрабатываются путем гомологичной рекомбинации. Этот метод (SSDS) основан на обнаружении резецированных концов оцДНК на DSB. Единственная разница для митотических разрывов будет заключаться в том, что вы не можете использовать анти-DMC1 для ChIP. Вместо этого вы должны использовать в ChIP либо анти-Rad51, либо анти-RPA.