Информация

Перенос полос электрофореза на МС

Перенос полос электрофореза на МС


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Меня смущает лабораторный вопрос. Чтобы прояснить, это вопрос домашнего задания, но я провел обширное исследование и не могу найти того, что кажется "хорошим" ответом.

Вопрос в следующем: перечислите шаги, которые необходимо предпринять между удалением полосы гель-электрофореза и МС?

Единственное, что я могу придумать, - это очистить образец от солей, если использовалось высаливание, и удаление любых моющих средств, которые использовались, например, SDS. Вопрос, похоже, подразумевает, что существует определенный порядок или шаги, которые заставляют меня думать, что я что-то упускаю. Любые мысли приветствуются.


Вы должны удалить соли, удалить краситель, переварить белок, извлечь из геля переваренные пептиды и т. Д.

Подробнее см. В этом протоколе.


Полоса пропускания белка в гель-электрофорезе: основная функция расстояния миграции§

Просмотры статей - это COUNTER-совместимая сумма загрузок полных текстов статей с ноября 2008 года (как в формате PDF, так и в формате HTML) всеми организациями и отдельными лицами. Эти показатели регулярно обновляются, чтобы отразить использование за последние несколько дней.

Цитирования - это количество других статей, цитирующих эту статью, рассчитывается Crossref и обновляется ежедневно. Узнайте больше о подсчете цитирований Crossref.

Альтметрическая оценка внимания - это количественная мера внимания, которое исследовательская статья получила в Интернете. При нажатии на значок пончика загружается страница на altmetric.com с дополнительной информацией о счете и присутствии данной статьи в социальных сетях. Найдите дополнительную информацию об альтернативном показателе внимания и о том, как он рассчитывается.


Когда анализ олигоклональных полос обнаруживает 2 или более уникальных полос IgG в спинномозговой жидкости (CSF), результат является положительным.

CSF используется в диагностике рассеянного склероза (MS) путем качественного определения повышенного интратекального синтеза IgG (олигоклональные полосы). Наличие 2 или более уникальных олигоклональных полос спинномозговой жидкости было повторно введено в качестве одного из диагностических критериев для РС в пересмотренных критериях Макдональда 2017 года. Эти данные, однако, не специфичны для рассеянного склероза, поскольку специфический для спинномозговой жидкости синтез IgG также может быть обнаружен у пациентов с другими неврологическими заболеваниями, включая инфекционные, воспалительные, цереброваскулярные и паранеопластические расстройства. Рекомендуется клиническая корреляция.


Диапазоны процентного разделения полиакриламидного геля

Концентрация акриламида (%) Диапазон разделения (кДа)
5 60-210
7.5 35-95
10 15-70
15 4-45
4-12 градиент 5-200
4-20 градиент 4-200
10-20 градиент 3.5-110

Процент и толщина геля будут влиять на перенос белков из геля на этапе блоттинга, поэтому использование более тонкого геля или более низкого процентного содержания акриламида может улучшить результаты переноса.

Как только гель затвердеет, его помещают в рабочий аппарат. Небольшие объемы белка (5-20 мл), растворенного в буфере для загрузки геля, добавляют в каждую отдельную лунку. Затем гель подключают к источнику питания и оставляют работать в течение нескольких часов в буферном резервуаре для разделения белков. Если гель работает под слишком высоким напряжением, он перегреется и деформирует полосы. В сопутствующем геле показаны клеточные лизаты, которые были хорошо разделены на градиентном геле и окрашены красителем Кумасси для визуализации всех разделенных полос белка.

Фигура 7: Лизаты клеток HeLa (LYS001), разделенные на 4-12% градиентном геле


Запасные белки семян как система обучения идентификации белков с помощью масс-спектрометрии в биохимической лаборатории

Масс-спектрометрия (МС) стала важным инструментом в изучении биологических систем. Одним из приложений является идентификация белков и пептидов путем сопоставления масс пептидов и пептидных фрагментов с последовательностями белков в базах данных последовательностей белков. Часто требуется предварительное разделение белков сложных белковых смесей с помощью 2D-PAGE, что требует больше времени и опыта, чем могут выделить инструкторы крупных лабораторных классов. Мы разработали экспериментальный модуль для нашего курса «Лаборатория биохимии», который вовлекает студентов в идентификацию белков на основе рассеянного склероза после разделения белков с помощью одномерного SDS-PAGE, метода, который обычно преподается в этом типе курсов. Модуль основан на запасных белках семян сои, относительно простой смеси белков, присутствующих в большом количестве в семенах, что позволяет идентифицировать основные белковые полосы с помощью МС / МС, а в некоторых случаях даже путем фингерпринта пептидной массы. Студенты могут идентифицировать свои белковые полосы с помощью программного обеспечения, доступного в Интернете, и им предлагается вывести посттрансляционные модификации, которые произошли при прорастании. Также были собраны сборник масс-спектральных данных и учебные пособия, которые можно использовать в качестве автономного компьютерного лабораторного модуля.

Авторские права © 2013 International Union of Biochemistry and Molecular Biology, Inc.


Сходства между южным северным и вестерн-блоттингом

  • Саузерн-блоттинг, Нозерн-блоттинг и Вестерн-блоттинг - это три метода блоттинга, используемые для идентификации определенного типа макромолекул в образце.
  • Методы блоттинга состоят из трех этапов: электрофореза, переноса и обнаружения.
  • Каждый метод требует денатурации и блокирования избытком соответствующей макромолекулы.
  • У каждого метода есть приложения в биотехнологии и медицине.

Краткая история и развитие дзета-потенциала

Дзета-потенциал - это научный термин, обозначающий электрокинетический потенциал в коллоидных дисперсиях. В предшествующей литературе он обычно обозначается с использованием греческой буквы дзета, & дзета, поэтому он получил название дзета-потенциал как & дзета-потенциал. Самая ранняя теория для расчета дзета-потенциала на основе экспериментальных данных была разработана Марианом Смолуховским в 1903 году (рисунок ( PageIndex <2> )). Даже сегодня эта теория остается наиболее известным и широко используемым методом расчета дзета-потенциала.

Рисунок ( PageIndex <2> ) Портрет польского физика Мариана Смолуховского (1872-1917), пионера статистической физики.

Интересно, что изначально эта теория была разработана для электрофореза. Позже люди начали применять его теорию для расчета дзета-потенциала. Основная причина, по которой эта теория сильна, заключается в ее универсальности и применимости для дисперсных частиц любой формы и любой концентрации. Тем не менее, у этой ранней теории все еще есть некоторые ограничения, поскольку она в основном была определена экспериментально. Основные ограничения заключаются в том, что теория Смолуховского не учитывает вклад поверхностной проводимости и работает только для частиц, размер которых намного больше, чем интерфейсный слой, обозначаемый как & kappaа (1 / & каппа называется длиной Дебая, а - радиус частицы).

Овербек и Бут, первые пионеры в этом направлении, начали развивать более теоретические и строгие электрокинетические теории, которые смогли включить поверхностную проводимость для электрокинетических приложений. Современные строгие электрокинетические теории, которые справедливы почти для любого & kappaa, в основном созданы украинскими (Духин) и австралийскими (O & rsquoBrien) учеными.

Принцип анализа дзета-потенциала

Электрокинетические явления

Поскольку между поверхностью и раствором существует двойной электрический слой (EDL), любое относительное движение между жесткой и подвижной частями EDL приведет к генерации электрокинетического потенциала. Как описано выше, дзета-потенциал - это, по сути, электрокинетический потенциал, который возникает из электрокинетических явлений. Поэтому важно понимать различные ситуации, в которых может возникнуть электрокинетический потенциал. Обычно существует четыре основных способа получения дзета-потенциала: электрофорез, электроосмос, потенциал течения и потенциал седиментации, как показано на рисунке ( PageIndex <3> ).

Рисунок ( PageIndex <3> ) Взаимосвязь между четырьмя типами электрокинетических явлений (www.americanpharmaceuticalrev. 2-Measurement /)

Расчеты дзета-потенциала

Есть много разных способов вычисления дзета-потенциала. В этом разделе будут представлены методы расчета дзета-потенциала в электрофорезе и электроосмосе.

Дзета-потенциал в электрофорезе

Электрофорез - это движение заряженных коллоидных частиц или полиэлектролитов, погруженных в жидкость, под действием внешнего электрического поля. В таком случае электрофоретическая скорость vе (мс -1) - скорость во время электрофореза и электрофоретическая подвижность, u & shy & shyе (м 2 В -1 с -1) - величина скорости, деленная на величину напряженности электрического поля. Подвижность считается положительной, если частицы движутся в сторону более низкого потенциала, и отрицательной в противном случае. И поэтому имеем соотношение vэ & застенчивый= uеE, где E - приложенное извне поле.

Таким образом, формула, учитывающая дзета-потенциал в случае электрофореза, представлена ​​в EQ, где & epsilonRS относительная диэлектрическая проницаемость раствора электролита, & epsilon0 - электрическая проницаемость вакуума, & eta - вязкость.

Есть два случая относительно размера & kappaa:

  1. & kappaa & lt 1: формула аналогична ref <3>.
  2. & kappaa & gt 1: формула довольно сложная, и нам нужно решить уравнение для дзета-потенциала, ref <4>, где (y ^= e zeta / kT ), m составляет около 0,15 для водного раствора.
Дзета-потенциал в электроосмосе

Электроосмос - это движение жидкости через фиксированный набор частиц, пористую пробку, капилляр или мембрану в ответ на приложенное электрическое поле. Подобно электрофорезу, он имеет электроосмотическую скорость vэо (мс -1) как равномерная скорость жидкости вдали от заряженной границы раздела. Обычно измеряемая величина представляет собой объемный расход жидкости, деленный на напряженность электрического поля Qэо, E (м 4 В -1 с -1) или под действием электрического тока, Qэо, I (м 3 C -1). Следовательно, связь задается ref <5>.

Таким образом, формула, учитывающая дзета-потенциал в электроосмосе, приведена в EQ.

Как и в случае с электрофорезом, есть два случая относительно размера & каппаа:

  • & kappaa & gt & gt1 и поверхностная проводимость отсутствует, где Ac - площадь поперечного сечения, а KL - объемная проводимость частицы.
  • & kappaa & lt 1, ref <6>, где ( Delta u = frac><>> ) - это число Духина, учитывающее поверхностную проводимость, (K ^ < sigma> ) - поверхностная проводимость частицы.

Связь между дзета-потенциалом и стабильностью частиц при электрофорезе

Используя вышеуказанные теоретические методы, мы можем рассчитать дзета-потенциал для частиц при электрофорезе. Следующая таблица суммирует поведение стабильности коллоидных частиц по отношению к дзета-потенциалу. Таким образом, мы можем использовать дзета-потенциал для предсказания стабильности коллоидных частиц в электрокинетических явлениях электрофореза.

Таблица ( PageIndex <1> ) Поведение устойчивости коллоидных частиц по отношению к дзета-потенциалу.
Дзета-потенциал (мВ) Устойчивое поведение частиц
От 0 до & plusmn5 Быстрая коагуляция или флокуляция
от & plusmn10 до & plusmn30 Начальная нестабильность
от & plusmn30 до & plusmn40 Умеренная стабильность
от & plusmn40 до & plusmn60 Хорошая стабильность
Более & plusmn61 Отличная стабильность


Использованная литература

Андерсон Дж. М., Чоу В. С., Де Лас Ривас Дж.: Динамическая гибкость в структуре и функции фотосистемы II в тилакоидных мембранах высших растений: грандиозная загадка. Photosynth Res. 2008, 98: 575-587. 10.1007 / s11120-008-9381-3.

Mullineaux CW: Функции и эволюция граны. Trends Plant Sci. 2005, 10: 521-525. 10.1016 / j.tplants.2005.09.001.

Кирхгоф Х., Треммель I, Хаазе В., Кубичек У.: Супрамолекулярная организация фотосистемы II в тилакоидных мембранах грана: доказательства структурного расположения. Биохимия. 2004, 43: 9204-9213. 10.1021 / bi0494626.

Dekker JP, Boekema EJ: Супрамолекулярная организация белков тилакоидной мембраны в зеленых растениях. Biochim Biophys Acta. 2005, 1706: 12-39. 10.1016 / j.bbabio.2004.09.009.

Бородич А., Рождественский И., Коттам М., Оквист Г.: Сегрегация фотосистем тилакоидов зависит от их размера. Biochim Biophys Acta. 2003, 1606: 73-82. 10.1016 / S0005-2728 (03) 00085-9.

Чоу В.С., Ким Э.Х., Хортон П., Андерсон Дж. М.: Гранал укладки тилакоидных мембран в хлоропластах высших растений: действующие физико-химические силы и вытекающие из них функциональные последствия. Photoch Photobio Sci. 2005, 4: 1081-1090. 10.1039 / b507310n.

Даниэльссон Р., Суорса М., Пааккаринен В., Альбертссон П. Å, Стайринг С., Аро Э. М., Мамедов Ф .: Димерная и мономерная организация фотосистемы II. Распределение пяти различных комплексов в разных доменах тилакоидной мембраны. J Biol Chem. 2006, 281: 14241-14249. 10.1074 / jbc.M600634200.

Нильд Дж., Барбер Дж.: Уточнение структурной модели суперкомплекса Photosystem II высших растений. Biochim Biophys Acta. 2006, 1757: 353-361. 10.1016 / j.bbabio.2006.03.019.

Мамедов Ф., Даниэльссон Р., Гаджиева Р., Альбертссон П-Е, Стайринг С.: ЭПР-характеристика фотосистемы II из различных доменов тилакоидной мембраны. Биохимия. 2008, 47: 3883-3891. 10.1021 / bi701913k.

Klimmek F, Ganeteg U, Ihalainen J, van Roon H, Jensen PE, Scheller HV, Dekker JP, Jansson S: Структура светособирающего комплекса I высших растений: характеристика in vivo и структурная взаимозависимость белков Lhca. Биохимия. 2005, 44: 3065-3073. 10.1021 / bi047873g.

Garstka M, Drożak A, Rosiak M, Venema JH, Kierdaszuk B, Simeonova E, van Hasselt PR, Dobrucki J, Mostowska A: Светозависимое обращение вызванных темным холодом изменений в структуре хлоропластов и расположении хлорофилл-белковых комплексов в фасоли тилакоидные мембраны. Biochim Biophys Acta. 2005, 1710: 13-23. 10.1016 / j.bbabio.2005.08.006.

Garstka M, Venema JH, Rumak I., Gieczewska K, Rosiak M, Kozioł-Lipińska J, Kierdaszuk B., Vredenberg WJ, Mostowska A: Контрастное влияние темного охлаждения на структуру хлоропластов и расположение хлорофилл-белковых комплексов в горохе и томатах - растения с разной восприимчивостью к незамерзающим температурам. Planta. 2007, 226: 1165-1181. 10.1007 / s00425-007-0562-7.

Аллен Дж. Ф., Форсберг Дж.: Молекулярное распознавание в структуре и функции тилакоидов. Trends Plant Sci. 2001, 6: 317-326. 10.1016 / S1360-1385 (01) 02010-6.

Чуарцман С.Г., Нево Р., Шимони Э., Чаруви Д., Поцелуй В., Охад И., Бруменфельд В., Райх З .: Ремоделирование тилакоидной мембраны во время смены состояний у Arabidopsis. Растительная клетка. 2008, 20: 1029-1039. 10.1105 / tpc.107.055830.

Тикканен М., Нурми М., Суорса М., Даниэльссон Р., Мамедов Ф., Стайринг С., Аро Э. М.: Регулирование распределения энергии возбуждения между двумя фотосистемами у высших растений, зависящее от фосфорилирования. Biochim Biophys Acta. 2008, 1777: 425-432. 10.1016 / j.bbabio.2008.02.001.

Rock ChD, Bowlby NR, Hoffmann-Benning S, Zeevaart JAD: aba-мутант Arabidopsis thalina (L.) Heynh. снижает выход флуоресценции хлорофилла и уменьшает наложение тилакоидов. Plant Physiol. 1992, 100: 1796-1801. 10.1104 / pp.100.4.1796.

Ido K, Ifuku K, Yamamoto Y, Ishihara S, Murakami A, Takabe K, Miyake C, Sato F: нокдаун белка PsbP не предотвращает сборку димерного основного комплекса PSII, но ухудшает накопление суперкомплексов фотосистемы II в табаке. Biochim Biophys Acta. 2009, 1787: 873-881. 10.1016 / j.bbabio.2009.03.004.

Kim EH, Li XP, Razeghifard R, Anderson JM, Niyogi KK, Pogson BJ, Chow WS: Множественные роли светособирающих комплексов хлорофилл a / b-белок определяют структуру и оптимизируют функцию хлоропластов Arabidopsis: исследование с использованием двух хлорофиллов b -без мутантов. Biochim Biophys Acta. 2009, 1787: 973-984. 10.1016 / j.bbabio.2009.04.009.

Рубан А.В., Вентворт М., Якушевская А.Е., Андерссон Дж., Ли П.Дж., Кигстра В., Деккер Дж. П., Боекема Е.Дж., Янссон С., Хортон П. Растения, лишенные основного светособирающего комплекса, сохраняют макроорганизацию фотосистемы II. Природа. 2003, 421: 648-652. 10.1038 / природа01344.

Мехта М., Сарафис В., Кричли С. Архитектура тилакоидной мембраны. Aust J Plant Physiol. 1999, 26: 709-716. 10.1071 / PP99068.

Vacha F, Adamec F, Valenta J, Vacha M: Пространственное расположение пигментно-белковых комплексов фотосистемы в тилакоидных мембранах хлоропластов Pisum sativum, изученное с помощью флуоресценции хлорофилла. J Lumin. 2007, 122–123: 301–303.

Хасегава М., Шиина Т., Теразима М., Кумазаки С.: Селективные фотосистемы в хлоропластах внутри листьев растений, наблюдаемые с помощью спектральной флуоресцентной микроскопии на основе лазера в ближнем инфракрасном диапазоне. Physiol растительной клетки. 2010, 51: 225-238. 10.1093 / pcp / pcp182.

Storf S, Stauber EJ, Hippler M, Schmid VHR: Proteomic Analysis of the Photosystem I Light-Harvesting Antenna in Tomato (Lycopersicon esculentum). Биохимия. 2004, 43: 9214-9224. 10.1021 / bi0498196.

Domonkos I, Malec P, Sallai A, Kovács L, Itoh K, Shen G, Ughy B, Bogos B, Samurai I, Kis M, Strzalka K, Wada H, Itoh S, Farkas T, Gombos Z: фосфатидилглицерин необходим для олигомеризации реакционного центра фотосистемы I. Plant Physiol. 2004, 134: 1471-1478. 10.1104 / стр.103.037754.

Аллен К.Д., Стэхелин Л.А.: Разрешение от 16 до 20 комплексов хлорофилл-белок с использованием системы природного зеленого геля с низкой ионной силой. Анальная биохимия. 1991, 194: 214-222. 10.1016 / 0003-2697 (91) 90170-Х.

Баррос Т., Роян А., Штандфусс Дж., Дреув А., Кюльбрандт В. Кристаллическая структура светособирающего комплекса растений показывает активное, передающее энергию состояние. EMBO J. 2009, 28: 298-306. 10.1038 / emboj.2008.276.

Gruszecki WI, Gospodarek M, Grudziński W, Mazur R, Gieczewska K, Garstka M: вызванное светом изменение конфигурации связанного с LHCII ксантофилла (предварительно отнесенного к виолаксантину): исследование резонансного комбинационного рассеяния. J. Physical Chemistry B. 2009, 113: 2506-2512. 10.1021 / jp8101755.

Андреева А., Стоичкова К., Бушева М., Апостолова Е.: Изменения в распределении энергии между хлорофилл-белковыми комплексами тилакоидных мембран мутантов гороха с измененным содержанием пигмента I. Изменения из-за измененного содержания пигмента. J. Photochem and Photobiol B. 2003, 70: 153-162. 10.1016 / S1011-1344 (03) 00075-7.

Рубан А.В., Ли П.Дж., Вентворт М., Янг А.Дж., Хортон П.: Определение стехиометрии и силы связывания ксантофиллов с светособирающими комплексами Фотосистемы II. J. Биологическая химия. 1999, 274: 10458-10465. 10.1074 / jbc.274.15.10458.

Деккер Дж. П., Хассольдт А., Петтерсон А., ван Рун Х., Гроот М. Л., ван Гронделл Р. О природе излучения F695 и F685 Фотосистемы II в Фотосинтезе. В «От света к биосфере». Том 2. Под редакцией Дордрехта М.П .: Kluwer 1995: 53–56.

Рубан А.В., Янг А.Дж., Хортон П.: Динамические свойства минорных белков, связывающих хлорофилл a / b фотосистемы II, модель in vitro для рассеяния фотозащитной энергии в фотосинтетической мембране зеленых растений. Биохимия. 1996, 35: 674-678. 10.1021 / bi9524878.

Шиффель П., Браунова З .: Высвобождение и агрегация светособирающего комплекса в интактных листьях, подверженных сильному дефициту СО2. Photosynth Res. 1999, 61: 217-226. 10.1023 / А: 1006298111894.

Рубан А.В., Калкоен Ф., Ква SLS, ван Гронделл Р., Хортон П., Деккер Дж. П.: Характеристика LHCII в агрегированном состоянии с помощью спектроскопии линейного и кругового дихроизма. Biochim Biophys Acta. 1997, 1321: 61-70. 10.1016 / S0005-2728 (97) 00047-9.

Gruszecki WI, Grudzinski W, Gospodarek M, Patyra M, Maksymiec W: индуцированная ксантофиллом агрегация LHCII как переключатель между системами сбора света и рассеивания энергии. Biochim Biophys Acta. 2006, 1757: 1504-1511. 10.1016 / j.bbabio.2006.08.002.

Рубан А.В., Рез Д., Паскаль А.А., Хортон П.: Механизм ΔpH-зависимой диссипации поглощенной энергии возбуждения фотосинтетическими мембранами: II. Взаимосвязь между агрегацией in vitro и qE у изолированных тилакоидов. Biochim Biophys Acta. 1992, 1102: 39-44. 10.1016 / 0005-2728 (92) 90062-7.

Бейкер Н.Р., Розенквист Э.: Применение флуоресценции хлорофилла может улучшить стратегии растениеводства: изучение будущих возможностей. J Exp Bot. 2004, 55: 1607-1621. 10.1093 / jxb / erh196.

Neubauer C, Schreiber U: Многофазный рост флуоресценции хлорофилла в начале сильного непрерывного освещения. I. Характеристики белков и частичный контроль акцептором фотосинтеза II. 1987, 42с: 46-54.

Штрассер Р.Дж., Шривастава А., Говинджи: Полифазный хлорофилл - переходная флуоресценция у растений и цианобактерий. Photochem Photobiol. 1995, 61: 32-42. 10.1111 / j.1751-1097.1995.tb09240.x.

Штрассер Р.Дж., Цимилли-Майкл М., Шривастава А: Анализ переходной флуоресценции. В флуоресценции хлорофилла. В сигнатуре фотосинтеза. Успехи в серии фотосинтеза и дыхания. Под редакцией PapageorgiouGC, Govindjee .: Springer 2004: 321–362.

Лазар Д: Рост флуоресценции полифазного хлорофилла, измеренный при высокой интенсивности возбуждающего света. Funct Plant Biol. 2001, 33: 9-30.

фотоэлектрохимический контроль флуоресценции хлорофилла с точки зрения моделей захвата фотосистемы II. Во флуоресценции хлорофилла: признак фотосинтеза. Достижения в серии фотосинтеза и дыхания. Под редакцией Папагеоргиу Г.К., Говинджи .: Springer 2004: 34–195.

Zhu X-G, Govindjee, Baker NR, Dde Sturler E, Ort DR, Long SP: Кинетика индукции флуоресценции хлорофилла a в листьях, предсказанная на основе модели, описывающей каждый дискретный шаг энергии возбуждения и переноса электронов, связанный с Фотосистемой II. Planta. 2005, 223: 114-133. 10.1007 / s00425-005-0064-4.

Энрикес Ф.С.: Флуоресценция хлорофилла листьев: предпосылки и основы для растений. Bot Rev.2009, 75: 249-270. 10.1007 / s12229-009-9035-у.

Вреденберг WJ: Кинетический анализ и математическое моделирование первичных фотохимических и фотоэлектрохимических процессов в фотосистемах растений. Биосистемы. 2011, 103: 138-151. 10.1016 / j.biosystems.2010.10.016.

Ким Э. Х., Чоу В. С., Хортон П., Андерсон Дж. М.: Укладка тилакоидных мембран с помощью энтропии. Biochim Biophys Acta. 2005, 1708: 187-195. 10.1016 / j.bbabio.2005.03.011.

Шимони Э., Рав-Хон О, Охад И., Брамфельд В., Райх З .: Трехмерная организация тилакоидных мембран хлоропластов высших растений, выявленная с помощью электронной томографии. Растительная клетка. 2005, 17: 2580-2586. 10.1105 / tpc.105.035030.

Мустарди Л., Баттл К., Стейнбах Г., Гараб Г.: Трехмерная сеть тилакоидных мембран у растений: квазигелическая модель сборки гранум-строма. Растительная клетка. 2008, 20: 2552-2557. 10.1105 / tpc.108.059147.

Альбертссон П-Å, Андреассон Э: Постоянное соотношение гран и стромальных пластинок в хлоропласте растений. Physiol Plantarum. 2004, 121: 334-342. 10.1111 / j.0031-9317.2004.00315.x.

Иоаннидис Н.Э., Ортигоса С.М., Вераменди Дж., Пинто-Марихуан М., Флек I, Карвахал П., Котзабасис К., Сантос М., Торне Дж. М.: Ремоделирование тилакоидов табака за счет сверхэкспрессии пластидной трансглутаминазы кукурузы. Biochim Biophys Acta. 2009, 1787: 1215-1222. 10.1016 / j.bbabio.2009.05.014.

Caffarri S, Kouŕil R, Kereïche S, Boekema EJ, Croce R: Функциональная архитектура суперкомплексов фотосистемы II высших растений. EMBO J. 2009, 28: 3052-3063. 10.1038 / emboj.2009.232.

Boekema EJ, van Breemen JF, van Roon H, Dekker JP: Конформационные изменения в суперкомплексах фотосистемы II при удалении внешних субъединиц. Биохимия. 2000, 39: 12907-12915. 10.1021 / bi0009183.

Кирхгоф Х., Ленхерт С., Бюхель С., Чи Л., Нильд Дж. П.: Исследование организации фотосистемы II в фотосинтетических мембранах с помощью атомно-силовой микроскопии. Биохимия. 2008, 47: 431-440. 10.1021 / bi7017877.

Кирхгоф Х., Хаазе В., Вегнер С., Даниэльссон Р., Аккерманн Р., Альбертссон П. А.: Формирование полукристаллических массивов Фотосистемы II в хлоропластах высших растений при слабом освещении. Биохимия. 2007, 46: 11169-11176. 10.1021 / bi700748y.

Пэн Л., Шимидзу Х., Шиканай Т.: Комплекс дегидрогеназы НАД (Ф) Н хлоропласта взаимодействует с фотосистемой I у арабидопсиса. J Biol Chem. 2008, 283: 34873-34879. 10.1074 / jbc.M803207200.

Pesaresi P, Lunde Ch, Jahns P, Tarantino D, Meurer J, Varotto C, Hirtz RD, Soave C, Scheller HV, Salamini F, Leister D: стабильный агрегат LHCII-PSI и подавление перехода фотосинтетического состояния в psae1-1 мутант Arabidopsis thaliana. Planta. 2002, 215: 940-948. 10.1007 / s00425-002-0835-0.

Иванов А.Г., Хендриксон Л., Крол М., Селстам Э., Оквист Г., Харри В., Хунер NPA: Дефицит дигалактозил-диацилглицерина ухудшает способность фотосинтетического межсистемного транспорта электронов и переходов состояний в Arabidopsis thaliana из-за ограничений со стороны акцептора Фотосистемы I. Physiol растительной клетки. 2006, 47: 1146-1157. 10.1093 / pcp / pcj089.

Rumak I, Gieczewska K, Kierdaszuk B, Gruszecki WI, Mostowska A, Mazur R, Garstka M: -D моделирование структуры хлоропластов при обработке (Mg2 +) ионами магния. Взаимосвязь между расположением тилакоидной мембраны и укладкой. Biochim Biophys Acta. 2010, 1797: 1736-1748. 10.1016 / j.bbabio.2010.07.001.

Хортон П., Рубан А. В., Уолтерс Р. Г.: Регулирование сбора света у зеленых растений. Annu Rev Plant Physiol Plant Mol Biol. 1996, 47: 655-684. 10.1146 / annurev.arplant.47.1.655.

Мюллер П., Ли Х-П, Нийоги К. К.: Нефотохимическое тушение: реакция на избыток световой энергии. Plant Physiol. 2001, 125: 1558-1566. 10.1104 / pp.125.4.1558.

Андерссон Дж., Вентворт М., Уолтерс Р.Г., Ховард К.А., Рубан А.В., Хортон П., Янссон С.: Отсутствие белков Lhcb1 и Lhcb2 светособирающего комплекса фотосистемы II - влияет на фотосинтез, укладку гран и приспособленность. Плант Дж. 2003, 35: 350-361. 10.1046 / j.1365-313X.2003.01811.x.

Краузе Г.Х., Янс П.: Нефотохимическое рассеяние энергии, определяемое тушением флуоресценции хлорофилла: характеристика и функция. Флуоресценция хлорофилла: признак фотосинтеза. Достижения в серии фотосинтеза и дыхания. Под редакцией Папагеоргиу Г.К .: Springer2004: 63–495.

Эльрад Д., Нийоги К.К., Гроссман А.Р.: основной светособирающий полипептид Фотосистемы II функционирует при рассеивании тепла. Растительная клетка. 2002, 14: 1801-1816. 10.1105 / tpc.002154.

Госс Р., Ороси С., Вильгельм К.: важность укладки гран для зависимого от ксантофиллового цикла NPQ в тилакоидных мембранах высших растений. Physiol Plantarum. 2007, 131: 496-507. 10.1111 / j.1399-3054.2007.00964.x.

Юсуф М.А., Кумар Д., Раджванши Р., Штрассер Р.Дж., Цимилли-Майкл М., Говинджи, Зарин Н.Б .: Сверхэкспрессия гена γ-токоферолметилтрансферазы в трансгенных растениях Brassica juncea снижает абиотический стресс: физиологические измерения и измерения флуоресценции хлорофилла А. Biochim Biophys Acta. 2010, 1797: 1428-1438. 10.1016 / j.bbabio.2010.02.002.

Кирхгоф Х .: Молекулярная скученность и порядок в фотосинтетических мембранах. Trends Plant Sci. 2008, 13: 201-207. 10.1016 / j.tplants.2008.03.001.

Kouřil R, Dekker JP, Boekema EJ: Супрамолекулярная организация фотосистемы II у зеленых растений. Biochim Biophys Acta. 2012, 1817: 2-12. 10.1016 / j.bbabio.2011.05.024.

Kirchhoff H, Haferkamp S, Allen JF, Epstein DBA, Mullineaux CW: Диффузия белков и макромолекулярное скопление в тилакоидных мембранах. Plant Physiol. 2008, 146: 1571-1578. 10.1104 / pp.107.115170.

Кирххофф Х., Мукерджи У., Галла Х.-Дж .: Молекулярная архитектура тилакоидной мембраны: пространство диффузии липидов для пластохинона. Биохимия. 2002, 41: 4872-4882. 10.1021 / bi011650y.

Leegood RC, Malkin R: Изоляция субклеточных фотосинтетических систем. InPhotosynthesis преобразования энергии, практический подход, Practical ApproachSeries. Под редакцией Hipkins MF, Baker NR. Оксфорд: IRL Press 1986: 9–26.

Хипкинс М.Ф., Бейкер Н.Р.: Спектроскопия. В передаче энергии фотосинтеза, практический подход, серия практических подходов. Под редакцией Hipkins MF, Baker NR.Oxford: IRL Press 1986: 51–101.

Shiell BJ, Beddome G, Michalski WP: Масс-спектрометрическая идентификация и характеристика белка нуклеокапсида вируса Менангле. J Virol Methods. 2002, 102: 27-35. 10.1016 / S0166-0934 (01) 00441-4.

Вреденберг В.Дж., Прасил О: Моделирование кинетики флуоресценции хлорофилла а в растительных клетках. Вывод описательного алгоритма. В инсилированном фотосинтезе. Понимание сложности от молекул до экосистем. Под редакцией Лайска А., Недбала Л .: Springer 2009: 125–149.


Когда игла вводится для забора крови, некоторые люди чувствуют умеренную боль. Другие чувствуют только укол или покалывание. После этого может появиться небольшая пульсация или небольшой синяк. Это скоро уйдет.

Белки состоят из аминокислот и являются важными частями всех клеток и тканей. В организме есть много разных видов белков, и у них много разных функций. Примеры белков включают ферменты, определенные гормоны, гемоглобин, липопротеины низкой плотности (ЛПНП или плохой холестерин) и другие.

Белки сыворотки подразделяются на альбумин или глобулины. Альбумин - самый распространенный белок в сыворотке. Он несет множество маленьких молекул. Это также важно для предотвращения утечки жидкости из кровеносных сосудов в ткани.

Глобулины делятся на альфа-1, альфа-2, бета и гамма-глобулины. Как правило, уровни альфа- и гамма-глобулиновых белков повышаются при воспалении в организме.

Электрофорез липопротеинов определяет количество белков, состоящих из белков и жиров, называемых липопротеинами (таких как холестерин ЛПНП).


Биологические науки - Программа бакалавриата по биологии

Биология, изучение живых существ, - это захватывающая и динамичная область, которая предлагает множество направлений. Аспирантура в области биологических наук дает возможность изучать вирусы, бактерии, простейшие, грибы, растения и животных, а также исследовать биохимические, физиологические, анатомические, поведенческие или экологические процессы, которые делают каждый организм уникальным. Конкретные области научных интересов факультета включают. паразитология, систематика насекомых и растений, картографирование растительности, физиология животных, растений и бактерий, трансдукция клеточного сигнала, геномика, микро- и макроэволюция, размножение позвоночных, системы спаривания животных, энтомология, поведенческая экология и экология водных и наземных экосистем.

Департамент биологических наук расположен в здании наук о жизни, в котором расположены учебные и исследовательские лаборатории, центр ядерной микроскопии и современный центр молекулярной биологии. Студенты также имеют доступ к близлежащему гербарию Уорнера, Государственному музею позвоночных Сэма Хьюстона, библиотеке Texas Bird Sound, объекту по выращиванию животных и теплице. Департамент также управляет Лабораторией экологических исследований Пайнивудса (PERL), полевой станцией площадью 250 акров в пяти милях от кампуса, которая занимается исследованиями и обучением.

Департамент биологических наук предлагает степени магистра и магистра биологии и является партнером по получению междисциплинарной степени магистра судебной медицины вместе с Колледжем уголовного правосудия и Департаментом химии. Степень магистра биологии позволяет специализироваться в одной из нескольких областей биологии и предназначена для тех студентов, которые планируют продолжить карьеру в области исследований или экологической биологии в государственных учреждениях и промышленности. Степень магистра биологии также подходит для студентов, планирующих продолжить обучение по программам докторантуры в других учреждениях или профессиональных школах. Степень магистра судебной медицины - это степень, которая готовит студента к работе или консультированию с различными агентствами в системе уголовного правосудия.

Степень магистра биологии предназначена в первую очередь для учителей средних школ, желающих повысить свою компетентность в области биологии. Эта степень не рекомендуется для студентов, которые планируют продолжить обучение в докторантуре. Students pursuing the Master of Education degree may specialize in Biology as a teaching field.

GRADUATE STUDENT SUPPORT

Competitive teaching and research assistantships are available to graduate students in Biology through the Department of Biological Sciences and individual faculty members, respectively. Teaching assistantships pay a stipend of $14,301 over nine months each year for at least two years. To apply for a teaching assistantship, a TA Application should be completed and sent to Graduate Program Coordinator, Department of Biological Sciences, 2000 Avenue I, Box 2116, Huntsville, TX 77341-2116. The deadline for TA applications is April 15 for admission in the fall and December 1 for admission in the spring. University scholarships are also available. The department also offers competitive research grants to support research activities and travel to scientific meetings. For additional support opportunities, see the College of Science and Engineering Technology scholarship page here.

Admission Requirements

Students seeking admission to the graduate program in the Biological Sciences must submit the Graduate Studies Application for Admission with the one-time application fee to the Office of Graduate Studies, official transcripts of all college-level work (including the transcript that shows the date the undergraduate degree was conferred), official GRE scores, and a statement of purpose. Two letters of recommendation from faculty in the undergraduate major field of study at the student&rsquos undergraduate degree-granting institution are required with the application for admission.

To be granted regular admission to the graduate program, applicants must have an undergraduate degree in biology or a related field. Applicants having an undergraduate degree in a discipline other than biology must successfully complete the equivalent of an undergraduate minor in the biological sciences before being considered for regular admission. For regular admission to the graduate program, applicants must also have a GRE score and undergraduate GPA in concordance with the following formula: <[( 200*GPA) Averaged % ranking] > 300 ]>. For a final admissions decision, GRE scores and undergraduate GPA do not constitute the primary criteria to end consideration of an applicant. Applicants with combined scores of slightly less than 300 using the above formula may be considered for probationary admission.

Master of Arts, 36 Semester Hours with a Minor, 30 Semester Hours without a Minor.

This degree program is well suited for many training objectives, but it is most often recommended for secondary teachers who wish to prepare in two fields. A student may opt to include a minor. This plan requires 32 semester hours (36 with a minor field) of graduate credit. If opting for the MA with a minor, 24 hours are taken in Biology, including BIO 5301 and BIO 5302, and 12 semester hours of graduate credit are required in a minor field that logically supports the major. Completion of a literature-based review paper is required.

Master of Science, 30 Semester Hours with Thesis.

This degree program is designed for those students who select all of their courses from those offered in the Biology program unless otherwise authorized by the Graduate Advisor and the faculty research advisor. Students with this degree are prepared for positions as professional biologists in the public or private sector, teaching at the college level or to begin doctoral programs in the biological sciences. This is a research-oriented degree requiring a thesis. This plan requires 32 semester hours of graduate credit, at least 26 of which must be in courses numbered 5000 or above. Six hours of thesis (3 hours each of BIO 6398 and BIO 6099) and BIO 5301, BIO 5302 (6 hours) are counted toward this 30-hour degree program.

Master of Science, 36 Semester Hours with a Minor and a Thesis.

Students with this degree are prepared for positions as professional biologists in the public or private sector, teaching at the college level or to begin doctoral programs in the biological sciences. This is a research-oriented degree requiring a thesis. This plan requires 36 semester hours of graduate credit. Included in the 36 hours are BIO 5301 and BIO 5302 (6 hours), BIO 6398 and BIO 6099 (minimum 6 hours of thesis), 18 hours of Biology courses and a minor of 12 hours in a field that supports the major. The minor must be approved by the minor-granting program.

Master of Education in Secondary Education.

This degree plan is designed primarily for the secondary teacher. All such degrees originate in the College of Education in the Department of Curriculum and Instruction and require the completion of a minimum of 36 hours of graduate credit, 30 of which must be in courses numbered 5000 or above. Twelve to 24 hours of professional education course work are required (12 hours minimum for minor and 6 hours minimum for a second minor). A comprehensive examination is required. Students may elect from 12 to 24 semester hours in biology in this 36-semester-hour program. A thesis is not required. Course requirements are adjusted to meet individual student needs by the M.Ed. program and the Graduate Advisor for Biology.

OTHER SCHOLARLY REQUIREMENTS

In order to receive the MA or MS degree, all graduate students are required to pass a comprehensive examination based on their course work and general biological concepts. The nature of this examination, which may be written and/or oral, will be determined by the faculty. Students must be enrolled the semester they take the comprehensive examination. For MA degrees, a literature-based review paper is prepared in consultation with the student's faculty advisor. Students must defend the literature-based review before the student's advisory committee, and present it to the faculty in seminar format. For MS degrees, students complete a thesis research project under supervision of the student's thesis advisor, and present the thesis to the faculty in seminar format. The thesis must also be defended before the student's thesis committee. Once enrolled in BIO 6099, a student must be continually enrolled until graduation.


Смотреть видео: Электротерапия. Исаева. (December 2022).